最佳项目
文学院（Faculty of Liberal Arts，FLA）BA
上智旗舰项目，完全用英语授课的文学学士。专业涵盖国际经济学、比较文化、社会研究。无需日语即可完成完整学位。是日本最早的英语授课文学院，也是大多数国际本科生选择上智的结构性原因。
国际关系学部 BA
国际法、外交史、地区研究与政治经济学。提供大量英语授课课程。通往日本外务省（Gaimusho）、东京联合国机构和驻东京外国大使馆的主要来源轨道。与八大外语学科之一组合，可形成双语外交职业画像。
外国语学部——八个语学学科 BA
英语、德语、法语、西班牙语、俄语、葡萄牙语，加上亚洲研究和更广泛的文学方向。各学科均配备母语教员。这一深度在日本国立大学的本科学科一级无人能及。在源国家拥有强力留学合作，毕业生具备真实双语或三语能力。
MSc Sustainability and Climate Change
2024年新设。英语授课研究生项目，结合环境科学、气候政策与可持续管理。将上智的国际事务和政策实力对接到一个对就业有直接相关性的技术领域。瞄准东京环境政策岗位、多边气候组织以及日本跨国公司的可持续发展职能。
神学院与哲学系
在世俗化的日本高等教育中较为罕见。天主教神学与哲学作为完整学术学科运行，而非礼仪性课程，反映上智的耶稣会教学传统。是部分学位轨道的必修组成部分。学术上与罗马宗座额我略大学（Pontifical Gregorian University）及全球耶稣会哲学网络具有直接传承。
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